More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1266 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  100 
 
 
178 aa  358  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3976  ribosomal protein L15  55.05 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  49.38 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  49.38 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  51.25 
 
 
146 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50.62 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.12 
 
 
146 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  47.5 
 
 
146 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  43.12 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  46.88 
 
 
146 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  46.88 
 
 
146 aa  131  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  46.3 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  47.5 
 
 
147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.8 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.8 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.84 
 
 
146 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  45 
 
 
147 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  45.28 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  46.25 
 
 
146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  46.2 
 
 
145 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  46.2 
 
 
145 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  43.87 
 
 
150 aa  125  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.12 
 
 
146 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  46.25 
 
 
146 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  44.38 
 
 
146 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  45.68 
 
 
150 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  44.03 
 
 
149 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  47.5 
 
 
146 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  46.54 
 
 
148 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  45 
 
 
147 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  45 
 
 
147 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1400  ribosomal protein L15  45.4 
 
 
151 aa  123  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  46.88 
 
 
146 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  46.25 
 
 
144 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  45.62 
 
 
146 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  44.94 
 
 
147 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
146 aa  121  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  45.62 
 
 
146 aa  121  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  42.77 
 
 
152 aa  121  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  42.24 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  45.62 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  44.94 
 
 
146 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  41.88 
 
 
146 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  44.94 
 
 
146 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  44.3 
 
 
149 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  47.8 
 
 
144 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  46.88 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  43.29 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  46.95 
 
 
148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  47.44 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  41.88 
 
 
145 aa  115  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  42.5 
 
 
148 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 
147 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  45.34 
 
 
153 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  43.12 
 
 
147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  48.75 
 
 
146 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  40.99 
 
 
147 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  44.38 
 
 
144 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  44.38 
 
 
144 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  44.65 
 
 
144 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  43.67 
 
 
144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  43.67 
 
 
144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  42.5 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  44.38 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  39.75 
 
 
149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  38.51 
 
 
153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  41.25 
 
 
145 aa  112  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  44.51 
 
 
184 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  42.86 
 
 
144 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  41.25 
 
 
144 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  43.29 
 
 
162 aa  111  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  43.04 
 
 
144 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  38.51 
 
 
152 aa  111  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  41.77 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  43.12 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  41.77 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  41.77 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0424  50S ribosomal protein L15P  42.68 
 
 
144 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41995  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  45 
 
 
144 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  40 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  42.5 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 
146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  38.89 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  41.36 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  38.18 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  43.48 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  40.62 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  40.12 
 
 
153 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  41.77 
 
 
144 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  41.14 
 
 
144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  44.38 
 
 
144 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  41.14 
 
 
144 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>