More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1832 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  73.86 
 
 		 184 aa  275  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  72.22 
 
 		 184 aa  264  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  66.49 
 
 		 187 aa  253  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  69.73 
 
 		 185 aa  252  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  67.6 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  62.98 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 147 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 149 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  48.73 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 176 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  43.71 
 
 		 152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 147 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  42.68 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  41.78 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  50 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 147 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 144 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  42.57 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 144 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  40.4 
 
 		 152 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  45.89 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  44.83 
 
 		 144 aa  104  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 147 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  40.67 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  42.86 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 144 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  42.95 
 
 		 144 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  43.45 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  45.99 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  45.86 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  42.31 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>