More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4362 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  100 
 
 		 148 aa  292  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  75.34 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  61.49 
 
 		 148 aa  169  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3143  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00353005  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0621  ribosomal protein L15  62.84 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  60.26 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  61.94 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 187 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 185 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0178  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  50 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1166  50S ribosomal protein L15  58.65 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 161 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  47.65 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  49.66 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  46.53 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  44.14 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  48.28 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  44.59 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  48.41 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  52.55 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  47.62 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  47.22 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>