More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2210 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  82.26 
 
 		 185 aa  309  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  76.88 
 
 		 184 aa  280  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  76.34 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  70.81 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  68.68 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  67.07 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  53.69 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  50.31 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 149 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 148 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  44.17 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  50 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  45.03 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  45.27 
 
 		 162 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  49.64 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  45.03 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  45.58 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  41.25 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  42.77 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  41.25 
 
 		 162 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 148 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  49.25 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  44.74 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  41.33 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3143  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00353005  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 146 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  46.75 
 
 		 163 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  44.37 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>