More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0378 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  69.33 
 
 		 150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1166  50S ribosomal protein L15  75.33 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  62.42 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  59.33 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  60.93 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0621  ribosomal protein L15  65.52 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  54 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  54.3 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 184 aa  137  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 184 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  53.33 
 
 		 146 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  52.63 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3143  50S ribosomal protein L15  53.59 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00353005  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0178  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  46.94 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 159 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>