More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0200 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  77.72 
 
 
184 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  75.14 
 
 
185 aa  287  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  76.88 
 
 
187 aa  280  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  72.13 
 
 
184 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  71.69 
 
 
184 aa  250  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  66.48 
 
 
182 aa  240  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  49.33 
 
 
147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  48.75 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.68 
 
 
149 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 
146 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
147 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
146 aa  119  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
147 aa  118  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
146 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  46.53 
 
 
147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
146 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
147 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
147 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
146 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
146 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  50 
 
 
148 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
148 aa  111  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 
146 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  43.45 
 
 
148 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 
148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  46.98 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  45.64 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
146 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  46.21 
 
 
147 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  44.16 
 
 
157 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  42.04 
 
 
152 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  46.05 
 
 
150 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  43.15 
 
 
147 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  42.14 
 
 
161 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
156 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 
147 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 
149 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
156 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 
146 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 
146 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  42.28 
 
 
148 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
146 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  47.26 
 
 
147 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  45.62 
 
 
155 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 
156 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  43.84 
 
 
149 aa  104  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  43.84 
 
 
146 aa  104  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
148 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
144 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
161 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  44.22 
 
 
162 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  40.41 
 
 
157 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  41.38 
 
 
148 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  40.13 
 
 
154 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
144 aa  101  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
144 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  44 
 
 
162 aa  101  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
144 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  45.86 
 
 
150 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  45.83 
 
 
146 aa  101  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
146 aa  101  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  42.68 
 
 
152 aa  101  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 
149 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  43.06 
 
 
149 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 
149 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 
149 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 
159 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
149 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  46 
 
 
153 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
144 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  45.14 
 
 
146 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  99  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  41.1 
 
 
145 aa  99.4  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
147 aa  99.4  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  44 
 
 
164 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 
162 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  41.5 
 
 
147 aa  98.2  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 
144 aa  98.2  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>