More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2046 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  60.4 
 
 		 149 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  58.78 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  58.11 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  58.39 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  48.98 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50.7 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  50.7 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  47.89 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  51.41 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  45.45 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  45.45 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 176 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  45.14 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  42.57 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  43.66 
 
 		 243 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  44.06 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  43.66 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  44.06 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  42.96 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  45.14 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  43.66 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  44.06 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  46.15 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  43.36 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  43.45 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2600  50S ribosomal protein L15  44.16 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0101139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  43.66 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  42.25 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  41.26 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  41.96 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  40.69 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  41.89 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>