More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2380 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  290  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  290  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  62.76 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 147 aa  185  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  65.52 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  63.45 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  61.38 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  60 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  62.07 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  60.96 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 153 aa  147  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  46.15 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0189  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0167  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  47.8 
 
 		 178 aa  129  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>