More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1166 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1166  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 150 aa  297  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337918  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  70 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  75.33 
 
 		 150 aa  179  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  63.09 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0621  ribosomal protein L15  62.76 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  55.33 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  59.33 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 184 aa  130  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  52.29 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3143  50S ribosomal protein L15  55.63 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00353005  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 187 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0178  50S ribosomal protein L15  55.33 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  47.97 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  54.2 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 161 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 169 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 169 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  52.03 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>