More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3143 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3143  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 150 aa  296  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00353005  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0621  ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0178  50S ribosomal protein L15  59.73 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  54.67 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  54.67 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  53.95 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  54.25 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  53.33 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 182 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 187 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  54.41 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 184 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 		 184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1166  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337918  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  44.3 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  45.27 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  46 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  44.83 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  43.14 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  42.67 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  45.03 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>