More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1555 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  100 
 
 
159 aa  318  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  67.57 
 
 
146 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  65.54 
 
 
146 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  64.86 
 
 
146 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  62.84 
 
 
146 aa  180  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  63.51 
 
 
146 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  63.51 
 
 
146 aa  178  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  62.84 
 
 
146 aa  176  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  62.84 
 
 
146 aa  176  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  65.54 
 
 
146 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  60.4 
 
 
147 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  62.84 
 
 
146 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  60.81 
 
 
146 aa  167  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  60.81 
 
 
146 aa  167  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
146 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
146 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  62.16 
 
 
146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  60.14 
 
 
146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  60.81 
 
 
147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  61.04 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  59.06 
 
 
147 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  57.43 
 
 
146 aa  157  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  57.05 
 
 
147 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  57.72 
 
 
147 aa  155  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  57.72 
 
 
147 aa  155  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 
147 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  58.11 
 
 
146 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  57.43 
 
 
144 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 
144 aa  150  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  56.95 
 
 
149 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  56.76 
 
 
146 aa  148  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  53.33 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  57.05 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 
146 aa  144  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  54.97 
 
 
149 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  58.65 
 
 
149 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 
148 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  56.67 
 
 
148 aa  141  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  49.33 
 
 
149 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  54.36 
 
 
146 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  52 
 
 
153 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
147 aa  134  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
146 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
146 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  57.38 
 
 
147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  54.41 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
153 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.32 
 
 
152 aa  131  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  47.17 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  50.67 
 
 
153 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  47.17 
 
 
159 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.68 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  45.16 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
152 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
147 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 
152 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
150 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
150 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
161 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 
147 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  51.66 
 
 
148 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 
170 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
145 aa  122  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  46.88 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  48 
 
 
153 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  45.39 
 
 
172 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
152 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  46.62 
 
 
176 aa  120  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0708  50S ribosomal protein L15  53.6 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000739813  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 
160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 
161 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 
145 aa  117  7e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  48.34 
 
 
150 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  47.1 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  45.78 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
159 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  44.81 
 
 
160 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>