More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2215 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  71.92 
 
 		 154 aa  223  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  67.35 
 
 		 161 aa  203  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  194  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  61.38 
 
 		 152 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  60.69 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  65.99 
 
 		 185 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  59.31 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  68.28 
 
 		 151 aa  182  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  67.13 
 
 		 155 aa  183  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0708  50S ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000739813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17231  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10774  predicted protein  50.66 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00378285  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  50.34 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 150 aa  133  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  43.06 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  52 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 		 146 aa  119  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  47.62 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  40.82 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 243 aa  116  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1400  ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  48.97 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  44.97 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  46.48 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  47.22 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 174 aa  114  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 172 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28269  Plastid ribosomal protein L15 large ribosomal subunit  45 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.445872  normal  0.307544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  42.11 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  50.34 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>