More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23201 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
185 aa  376  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  74.5 
 
 
150 aa  240  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  73.83 
 
 
150 aa  237  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  82.67 
 
 
151 aa  234  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  82.55 
 
 
151 aa  232  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  78.52 
 
 
155 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  67.81 
 
 
152 aa  227  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
152 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  67.12 
 
 
152 aa  224  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17231  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
152 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
154 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  65.99 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 
147 aa  178  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 
161 aa  174  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 
159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 
159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  60.48 
 
 
147 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0708  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
148 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000739813  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10774  predicted protein  51.55 
 
 
167 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00378285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 
146 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 
146 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
144 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  48.98 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 
146 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
146 aa  131  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  46.94 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.09 
 
 
146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 
146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  42.18 
 
 
146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  44.83 
 
 
146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 
146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 
146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  46.26 
 
 
149 aa  124  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  44.59 
 
 
147 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
144 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  48.63 
 
 
149 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 
147 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  47.97 
 
 
153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  44.59 
 
 
150 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  41.38 
 
 
149 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  43.79 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  41.5 
 
 
146 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  40.54 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  39.86 
 
 
153 aa  114  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  41.13 
 
 
154 aa  114  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  38.62 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  40.54 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  39.86 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  39.86 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  42.57 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
151 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  37.41 
 
 
145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  44.16 
 
 
154 aa  111  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  39.22 
 
 
164 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  48.63 
 
 
148 aa  111  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  42.18 
 
 
146 aa  111  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  44.96 
 
 
147 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  39.46 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  43.71 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  42 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  46.9 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  40.54 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  38.56 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  41.18 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  45.24 
 
 
159 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  40.79 
 
 
162 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  41.78 
 
 
146 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  41.78 
 
 
146 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
148 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  38.51 
 
 
147 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  38.51 
 
 
147 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  38.96 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  40.54 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  41.18 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  44.22 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 
145 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  38.56 
 
 
160 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>