More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2382 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  73.1 
 
 		 146 aa  200  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  71.72 
 
 		 146 aa  199  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  68.28 
 
 		 146 aa  193  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  189  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 		 147 aa  176  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  68.28 
 
 		 146 aa  173  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  64.14 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  57.24 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 148 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  58.62 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  59.31 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  56.94 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 146 aa  153  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  58.62 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  59.86 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  56.55 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 160 aa  133  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.63 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  61.07 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  53.64 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  56.85 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0445  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 152 aa  123  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000479613  hitchhiker  0.000107522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  46.53 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>