More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10774 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10774  predicted protein  100 
 
 
167 aa  336  7e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00378285  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  56.33 
 
 
152 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  54.43 
 
 
152 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  54.43 
 
 
152 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  51.55 
 
 
185 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17231  50S ribosomal protein L15  53.16 
 
 
152 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
150 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
150 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  54.9 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  54.25 
 
 
151 aa  137  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 
147 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  49.35 
 
 
159 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  49.35 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.5 
 
 
154 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  48.7 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  48.41 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  47.44 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  47.13 
 
 
146 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0708  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
148 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000739813  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 
147 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  48.03 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  45.81 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  43.23 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  43.87 
 
 
147 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 
146 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  43.31 
 
 
152 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  43.59 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  43.31 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  43.31 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
146 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  42.58 
 
 
148 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 
146 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
144 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  41.94 
 
 
146 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  43.14 
 
 
153 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  43.79 
 
 
153 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 
146 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 
146 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  43.95 
 
 
146 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  41.18 
 
 
153 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  40.65 
 
 
147 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  40.65 
 
 
147 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  42.58 
 
 
149 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  45.22 
 
 
149 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  40.13 
 
 
146 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28269  Plastid ribosomal protein L15 large ribosomal subunit  44.44 
 
 
222 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.445872  normal  0.307544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  46.41 
 
 
147 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  41.72 
 
 
147 aa  101  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  44.08 
 
 
147 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  42.58 
 
 
146 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  41.83 
 
 
144 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  39.87 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
145 aa  99  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  41.18 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  43.87 
 
 
144 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  43.4 
 
 
144 aa  99  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  42.31 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  38.96 
 
 
147 aa  98.2  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
144 aa  97.4  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  43.87 
 
 
147 aa  97.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  38.12 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  42.67 
 
 
144 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4671  50S ribosomal protein L15  43.05 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  41.4 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  39.49 
 
 
144 aa  95.5  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  45.75 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  37.89 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  37.89 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  37.89 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  45.75 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  41.29 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  37.89 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  37.89 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  45.75 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  37.89 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  39.75 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  41.83 
 
 
144 aa  94.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 
144 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0424  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
144 aa  94.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
144 aa  94.4  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  38.96 
 
 
145 aa  94.4  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
144 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
144 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
144 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
144 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
144 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0844463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>