More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2627 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 149 aa  294  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  88.51 
 
 		 154 aa  262  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  77.93 
 
 		 151 aa  233  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  80.28 
 
 		 153 aa  228  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  76.55 
 
 		 151 aa  226  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  74.48 
 
 		 158 aa  209  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  72.92 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  72.22 
 
 		 152 aa  206  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  71.72 
 
 		 146 aa  204  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  71.53 
 
 		 243 aa  202  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  71.03 
 
 		 146 aa  202  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  71.03 
 
 		 152 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  70.83 
 
 		 210 aa  200  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  68.06 
 
 		 177 aa  199  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  68.92 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 146 aa  194  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  66.9 
 
 		 164 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  67.36 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  70.34 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  67.13 
 
 		 162 aa  188  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  63.09 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  63.09 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  63.09 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  70.34 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  63.76 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  64.79 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  62.76 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  63.45 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  62.76 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  61.38 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  61.11 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  57.93 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  61.11 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  53.69 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  53.69 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  48.99 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  48 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  48.99 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  48 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  46.53 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  44.06 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1359  ribosomal protein L15  50.65 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>