More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2136 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 152 aa  297  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  52.29 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 147 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  53.25 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  54.9 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  52.6 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  52.6 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  52.6 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  48.7 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.29 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  51.32 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  49.35 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  46.67 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4671  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  50.65 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  46 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  49.02 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0167  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  51.66 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0738  ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0203  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  45.75 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  49.35 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  48.41 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  51.66 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  49.35 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0189  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0424  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>