More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0738 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0738  ribosomal protein L15  100 
 
 
144 aa  278  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  75 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  73.61 
 
 
144 aa  207  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  70.83 
 
 
144 aa  206  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  71.53 
 
 
144 aa  201  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  201  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  71.53 
 
 
144 aa  200  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  68.75 
 
 
144 aa  196  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  66.67 
 
 
144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  193  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  68.75 
 
 
144 aa  192  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0167  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  192  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  68.75 
 
 
144 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  69.44 
 
 
144 aa  191  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  191  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
144 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
144 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
144 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
144 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4671  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  190  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  190  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  190  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  70.83 
 
 
144 aa  190  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
144 aa  190  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
144 aa  190  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  65.28 
 
 
144 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  65.28 
 
 
144 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
144 aa  189  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0189  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0424  50S ribosomal protein L15  68.75 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0203  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  186  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  69.44 
 
 
144 aa  186  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06440  50S ribosomal protein L15  68.06 
 
 
144 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  68.75 
 
 
144 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0856  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09040  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
144 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.468992  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  64.58 
 
 
144 aa  184  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  68.06 
 
 
143 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  65.28 
 
 
144 aa  184  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  64.08 
 
 
146 aa  183  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  63.19 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5060  50S ribosomal protein L15  64.83 
 
 
145 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000270231  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  67.83 
 
 
144 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  60.14 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  61.81 
 
 
144 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  61.81 
 
 
144 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3890  50S ribosomal protein L15  64.58 
 
 
143 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000709059  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0445  50S ribosomal protein L15  61.54 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000479613  hitchhiker  0.000107522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2150  ribosomal protein L15  64.34 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0266224  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  60.14 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  60.14 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0503  50S ribosomal protein L15  61.11 
 
 
146 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000432191  normal  0.0734154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2306  ribosomal protein L15  58.45 
 
 
144 aa  164  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000818267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0508  50S ribosomal protein L15  61.81 
 
 
146 aa  164  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0880395  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  60.14 
 
 
144 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  61.11 
 
 
144 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  59.72 
 
 
144 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  57.75 
 
 
144 aa  157  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  58.33 
 
 
144 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  58.33 
 
 
144 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  58.33 
 
 
144 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  58.33 
 
 
144 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
144 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  60.14 
 
 
142 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  58.33 
 
 
144 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  58.33 
 
 
144 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  57.64 
 
 
144 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0786  ribosomal protein L15  55.94 
 
 
143 aa  154  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00496718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  58.59 
 
 
143 aa  146  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3278  50S ribosomal protein L15  59.38 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1219  hitchhiker  0.000182201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>