More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1574 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  100 
 
 		 172 aa  343  8.999999999999999e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 146 aa  173  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  58.9 
 
 		 146 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 148 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 147 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  167  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  55.48 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  160  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 147 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  58.5 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 147 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 148 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  54.67 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  51.41 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  53.06 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1848  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  52.48 
 
 		 144 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  50.33 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  46.5 
 
 		 161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  52.48 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  51.06 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  51.06 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  51.06 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>