More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4007 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 174 aa  350  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  91.12 
 
 		 174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  64.81 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  59.72 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  55.24 
 
 		 146 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  55.24 
 
 		 146 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  56.34 
 
 		 146 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  54.93 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 146 aa  140  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  50.7 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 146 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.77 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 148 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 152 aa  131  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  46.48 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  51.41 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  49.31 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  46.85 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  47.22 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  44.22 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  46.53 
 
 		 148 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  46 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  45.07 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  43.36 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  43.36 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  43.06 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  44.74 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  47.65 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  43.06 
 
 		 150 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  44.67 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  45.14 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>