More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1848 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1848  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  53.64 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.41 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  51.72 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  50 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  51.61 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  51.39 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.52 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  47.18 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  50.31 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.52 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0738  ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  51.41 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  46 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  41.56 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2600  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0101139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0786  ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00496718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  45.77 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4671  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2306  ribosomal protein L15  46.48 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000818267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5060  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000270231  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  47.68 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  48.3 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0203  50S ribosomal protein L15  46.48 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  46.48 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  46.48 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06440  50S ribosomal protein L15  47.89 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  44.76 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  40.85 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  44.76 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  45.07 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0167  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  44.76 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  42.25 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  42.25 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  46.43 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>