97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0088 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 140 aa  283  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  63.04 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  49.25 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  48.53 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  39.26 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  51.13 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  47.52 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 171 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  54.14 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  46.81 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  37.04 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  43.7 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  43.7 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  42.65 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  38.24 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  42.65 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  42.65 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  48.89 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  42.75 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  41.91 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  35.51 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  38.24 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  32.33 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  44.9 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  31.88 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  35.83 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  38.46 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  32.41 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  30.28 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  34.51 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  33.09 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  35.29 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  34.33 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  34.33 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  34.33 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  32.61 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  34.94 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  29.69 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  32.62 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  33.09 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  38.16 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  33.09 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  37.98 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  33.09 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  36.23 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  26.23 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  32.35 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  43.06 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  31.58 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  32.81 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  34.97 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  33.57 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  34.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  32.08 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  32.35 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  32.35 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  39.36 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  37.66 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  36.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  31.62 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  37.8 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  34.34 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  28.43 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  31.58 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  38.89 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  31.15 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  32.12 
 
 		 243 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  35.11 
 
 		 187 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  31.03 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  28.43 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  35 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  36.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  32.09 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  35.14 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  60 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  33.73 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  34.74 
 
 		 147 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>