56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0103 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  64.29 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  60.87 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  58.39 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  55.32 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  48.53 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  47.37 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  33.11 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  36.96 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  41.22 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  44.22 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  37.93 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  41.5 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  39.86 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  29.2 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  40.29 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  38.69 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  38.69 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  38.69 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  32.06 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  37.23 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  28.15 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  30.94 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  29.93 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  32.26 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  32.61 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  29.08 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  30.94 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  40.77 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  29.45 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  34.12 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  27.91 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  28.23 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  32.29 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  30.14 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  31.43 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  26.98 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  29.79 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  26.77 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  27.97 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  30.16 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  34.48 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  27.89 
 
 		 146 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  31.46 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  30.28 
 
 		 148 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  28.17 
 
 		 150 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  29.03 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  28.07 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  31.91 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  29.23 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  25.32 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  29.79 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  29.79 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  29.79 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  27.96 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>