44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1499 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  100 
 
 
141 aa  283  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  45.65 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  43.17 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  41.13 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  42.25 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  39.86 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  45.26 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  42.75 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  39.16 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  40.54 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  46.15 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  39.44 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  38.51 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  38.3 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  45 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  45 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  45 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  38.46 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  42.86 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  36.73 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  39.29 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  38.46 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  36.88 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  41.55 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.76 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.76 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  35.57 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  34.67 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  29.87 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  29.87 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  31.85 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1848  50S ribosomal protein L15  30.95 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  35.46 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  28.57 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  34.09 
 
 
152 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  29.2 
 
 
167 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  34.38 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  32.29 
 
 
169 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  32.29 
 
 
169 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  32.84 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  35.62 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  33.09 
 
 
153 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>