41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43162 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  100 
 
 
146 aa  294  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  69.39 
 
 
147 aa  208  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  69.39 
 
 
147 aa  208  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  63.7 
 
 
142 aa  177  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  59.06 
 
 
149 aa  173  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  57.72 
 
 
149 aa  166  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  36.62 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  32.86 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  32.82 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  36.69 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  35.51 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  33.55 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  35.21 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  34.97 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  35.21 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  34.51 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  34.51 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  30.82 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  28.76 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  31.91 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  33.77 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  30.85 
 
 
152 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  30.28 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  29.79 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  30 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0708  50S ribosomal protein L15  35.63 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000739813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  40 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  52.63 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
182 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  31.82 
 
 
184 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  31.47 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  31.47 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  33.02 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  45.61 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  31.17 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  30.71 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  47.5 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  32.14 
 
 
187 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  50.98 
 
 
147 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  31.51 
 
 
147 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>