35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0234 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  50.34 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  52.67 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  51.33 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  49.65 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  43.26 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  41.73 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  44.93 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  41.01 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  41.01 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  41.01 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  41.26 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  38.13 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  37.93 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.14 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.14 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  38.57 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  33.09 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  37.04 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  34.01 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  32.32 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  32.64 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  32.41 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  35.51 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  33.56 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  36.36 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  34.25 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  35.14 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  36.17 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  36.42 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  33.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  33.68 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>