50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0113 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  67.61 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  49.65 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  44.81 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  38.3 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  42.76 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  43.24 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  45.27 
 
 		 156 aa  95.9  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  36.88 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  36.88 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  36.17 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  34.75 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  39.72 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  38.62 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  34.87 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  33.55 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  31.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  31.63 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.64 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.64 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  32.99 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  33.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  26.19 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  26.92 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  33.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  30.61 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  33.67 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  31.11 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  31.43 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  29.08 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  28.26 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  29.07 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  31.29 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  30 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  32.61 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  34.12 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  28.99 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  32.98 
 
 		 158 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  34.69 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  30.08 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  33.67 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  32.98 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  36.92 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  31.52 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  26.98 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  36.36 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  34.41 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>