87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0023 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 
147 aa  296  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  63.04 
 
 
140 aa  139  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  40.69 
 
 
143 aa  107  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  50.38 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  47.37 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  33.58 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  45.77 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  46.27 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  42.96 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  39.42 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  45.39 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  48.12 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  32.17 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  43.05 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  42 
 
 
166 aa  66.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  34.97 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  32.17 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  31.21 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.61 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.61 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  29.77 
 
 
154 aa  52  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  27.46 
 
 
144 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  38.82 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  31.47 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  32.56 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  35.97 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  30.82 
 
 
149 aa  47.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  42.34 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  30.61 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  32.52 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  30.77 
 
 
148 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  27.56 
 
 
184 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 
151 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  34.81 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  30.5 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  34.97 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  30.77 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0663  50S ribosomal protein L15  30.53 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.158119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  35.42 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  29.93 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  31.21 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  31.54 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  28.95 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  30.61 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  31.71 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  31.58 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  29.25 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  41.18 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  34.53 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  29.93 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  34.81 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  34.81 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  30.26 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  28.93 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  29.31 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  32.62 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  32.62 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  28.3 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  30.16 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  31.03 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  31.03 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  31.4 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  28.17 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  30.65 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  32.35 
 
 
150 aa  42  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  32.61 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  33.57 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  28.45 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  30.46 
 
 
146 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  31.85 
 
 
147 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  32.86 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  30 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  31.16 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  37.08 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  32.33 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  31.45 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  31.76 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  48.72 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  32.12 
 
 
152 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>