40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0963 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 
156 aa  309  6.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  84.97 
 
 
155 aa  256  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  80.13 
 
 
156 aa  253  7e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  78.21 
 
 
156 aa  225  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  50.34 
 
 
151 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  47.77 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  44.81 
 
 
144 aa  106  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  41.22 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  49.34 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  40.14 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  39.26 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  38.78 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0436  hypothetical protein  89.36 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  35.42 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  37.01 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  38.24 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  39.13 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  36.69 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  32.17 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  36.05 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  29.07 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  30.22 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.71 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.71 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  35.14 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  32.56 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  32.89 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  34.03 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  31.76 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  31.65 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  33.1 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  36.59 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  29.55 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  33.33 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  30.92 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  31.5 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  30.14 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  37.97 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>