64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0464 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  62.68 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  63.38 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  57.34 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  58.39 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  40.29 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  43.7 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  32.64 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  42.96 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  39.16 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  30.22 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  41.89 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  40.97 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  39.6 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  40.71 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  40.71 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  40.71 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  39.57 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  30.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  39.44 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  40.54 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  30.94 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  34.43 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  27.01 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  33.9 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  31.65 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  32.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  33.61 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  28.46 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  30.77 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  29.27 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  32.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  31.03 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  30.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  30.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  34.44 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  30.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  32.19 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  32.14 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  38.97 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  31.43 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  29.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  27.86 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  31.2 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  30.71 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  29.22 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  31.25 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  31.16 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  30.22 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  27.34 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  30.58 
 
 		 148 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  28.46 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  28.46 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  30.3 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  28.68 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  32.52 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  30.47 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  31.93 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  31.03 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  25.52 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  23.08 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  27.86 
 
 		 147 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>