129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1706 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  100 
 
 
124 aa  247  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  48.89 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  40.43 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  42.25 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  41.55 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  42.25 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  42.25 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  40.56 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  40.85 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  40.43 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  40.85 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  42.34 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  36.36 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  34.68 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  34.31 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  41.91 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  32.84 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  41.04 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  36.43 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  49.12 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  39.51 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  36.96 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  35.87 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  39.56 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  35.29 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  32.77 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  39.16 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  33.88 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  40.7 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  35.25 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  41.77 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  36.07 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  38.37 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  32.77 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  36.97 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  41.09 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  38.37 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  34.09 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  42.47 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  35.83 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  38.3 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  38.67 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  39.02 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  39.44 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  35.63 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  36.59 
 
 
159 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  31.93 
 
 
243 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  41.79 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  39.02 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  36.7 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  33.61 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  34.83 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  29.06 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  34.33 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  37.21 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  32.77 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  31.15 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  44.07 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  40.3 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  39.39 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  36.05 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  41.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  36.47 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  36.47 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  33.87 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  52.17 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  41.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  47.27 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  37.5 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  61.11 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  38.52 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  38.52 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  38.52 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  45.28 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  30.58 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  39.19 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  39.19 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  33.61 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  36.76 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  35.96 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  31.39 
 
 
177 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  34.97 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  35.34 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  31.93 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>