39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0586 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  64.29 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  62.68 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  60 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  59.86 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  50.75 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  40.58 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  38.64 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  39.44 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  41.79 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  41.79 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  41.04 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  42.07 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  32.84 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  33.58 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  41.67 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  37.78 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  41.78 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  31.65 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  42.25 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  42.47 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  34.75 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  34.09 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  32.37 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  41.04 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  29.32 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  29.77 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  36.9 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  29.77 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  28.78 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  31.47 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  26.15 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  32.41 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  30.23 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  30.58 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  34.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  33.71 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  45.95 
 
 		 120 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>