28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1756 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  67.61 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  46.62 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  47.77 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  47.97 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  41.67 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  41.89 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  35.46 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  42.54 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  38.57 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  34.75 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  34.04 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  34.04 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  32.65 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  32.86 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  34.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.1 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.1 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  29.85 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  29.66 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  29.89 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  27.59 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  33.73 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  28.99 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  30.53 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  45 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>