20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77282 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  100 
 
 		 149 aa  302  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  73.83 
 
 		 149 aa  238  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  66.44 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  66.44 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  66.44 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  57.72 
 
 		 146 aa  166  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  34.67 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  36.05 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  33.56 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  35.71 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  32.31 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  34.42 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  35.71 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  29.66 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  35.06 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  36.25 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  30.61 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  34.9 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  33.57 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  30.84 
 
 		 151 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>