66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1252 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 143 aa  290  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  99.3 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  97.9 
 
 		 143 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  92.31 
 
 		 143 aa  246  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  65.03 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  41.73 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  39.01 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  37.59 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  35.38 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  39.33 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  42.65 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  38.1 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  39.44 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  37.32 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  37.66 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  41.1 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  45 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.93 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.93 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  41.79 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  40.71 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  37.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  38.36 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  40.54 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  29.84 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  28.78 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  38.69 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  30.89 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  31.75 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  35.81 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  42.25 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  32.52 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  33.09 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  37.18 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  30.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  31.71 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  30.3 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  38.89 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  31.5 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  31.5 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  30.16 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  39.56 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  30.16 
 
 		 144 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 154 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  28.23 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  30.94 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  29.37 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  32.63 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  30.95 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  31.3 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  31.3 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  27.27 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 149 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  30.77 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  29.93 
 
 		 144 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 149 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 149 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>