48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2427 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 165 aa  324  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  73.29 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  71.62 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  69.8 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  64.9 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  37.5 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  36.42 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  45.14 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  42.57 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  44.22 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  35.14 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  43.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  42 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  42.47 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  43.92 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  41.67 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  41.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  40.28 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  36.3 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  40.97 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  32.19 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  34.72 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  34.25 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  26.83 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  32.89 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  34.72 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  27.38 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  28.92 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  34 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  28.93 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  30.5 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  34.04 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  27.11 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  31.88 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  40.14 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  28 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  36.96 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  27.06 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  32.17 
 
 		 147 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  32.17 
 
 		 147 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  29.75 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  34.74 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  33.1 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  40 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>