36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1873 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 155 aa  306  5e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  84.97 
 
 		 156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  83.97 
 
 		 156 aa  253  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  82.69 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  52.67 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  43.24 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  40.54 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  40.82 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  40.14 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  39.29 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0436  hypothetical protein  91.49 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  37.42 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  35.03 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  37.91 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  35.66 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  38.24 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  35 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  32.17 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.25 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.25 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  30.94 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  26.74 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  28.83 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  32.64 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  34.72 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  31.94 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  37.8 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  31.29 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  28.09 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  31.94 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  32.37 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  30.93 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>