27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02420 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  66.44 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  66.44 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  65.31 
 
 		 147 aa  183  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  65.31 
 
 		 147 aa  183  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  63.7 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  37.41 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  37.93 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  37.01 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  34.87 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  34.04 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  36.77 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  38.35 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  36.62 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  38.35 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  37.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  35.06 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  34.42 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  31.94 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  45.05 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  38.36 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  33.79 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  28.89 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  30.22 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  30 
 
 		 146 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>