22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27402 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  69.39 
 
 
146 aa  208  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  66.44 
 
 
149 aa  201  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  64.43 
 
 
149 aa  199  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  65.31 
 
 
142 aa  183  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  37.14 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  33.1 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  32.58 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  30.71 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  32.64 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  32.88 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  32.88 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  32.45 
 
 
143 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  32.88 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  33.09 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  30.56 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  30.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  28.89 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  29.25 
 
 
156 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>