24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0401 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  43.33 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  41.78 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  37.76 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  39.71 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  42.25 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  35.21 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  35.21 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  39.22 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  34.51 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  34.29 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  33.33 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  33.8 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  37.84 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  33.11 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  34.69 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.23 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.23 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  37.06 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  37.23 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  32.61 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  38.51 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  30.07 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  33.9 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>