77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0732 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  91.61 
 
 
143 aa  246  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  92.31 
 
 
143 aa  245  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  91.61 
 
 
143 aa  244  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  63.64 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  41.01 
 
 
151 aa  111  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  38.78 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  37.59 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  40.82 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  41.5 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  36.88 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  34.62 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  39.07 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  43.7 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  38.1 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  37.32 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  38.73 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  37.01 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  39.73 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  40.82 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.44 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.44 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  39.04 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  37.04 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  39.57 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  42.86 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  37.78 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  41.22 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  29.84 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  42.96 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  30.08 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  28.46 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  41.43 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  32 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  34.56 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  30.08 
 
 
184 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  40 
 
 
154 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  37.23 
 
 
141 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  37.41 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  34.25 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  32.54 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  29.08 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  30.95 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  32.37 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  30.71 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  32.06 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  38.89 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  34.44 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  30.16 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  29.63 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  30.71 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  34.33 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 
151 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  29.27 
 
 
184 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  34.33 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0203  50S ribosomal protein L15  33.72 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  29.03 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  30.71 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  59.46 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  59.46 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  32.97 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  28.23 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  29.5 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  36.17 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  28.08 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  35.56 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>