35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0704 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  47.97 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  49.67 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  48.34 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  48.03 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  45.7 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  42.18 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  44.14 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  37.41 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  38.24 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  38.56 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  35.48 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  36.73 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  37.41 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  37.06 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  36.05 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  35.37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  37.41 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.89 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.89 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  34.44 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  34.09 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  32.26 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  34.94 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  29.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  36.56 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  30.77 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  26.67 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  33.77 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  41.89 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  30.52 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  32.26 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  26.6 
 
 		 184 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  30.84 
 
 		 190 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>