90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1406 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  66.43 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  65.73 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  65.03 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  63.64 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  43.26 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  41.22 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  38.3 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  35.46 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  40.69 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  40.54 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  37.4 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  38.51 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  38.51 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  39.26 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  35.33 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  37.41 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  40.74 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  42.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  36.62 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  39.86 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  40.29 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  34.67 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  39.73 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  32.58 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  38.78 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  35.46 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  38.19 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  35.46 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  38.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  36.72 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  37.41 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  32.82 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  34.04 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  32.79 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  34.07 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  34.65 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  33.88 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  31.29 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  33.61 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  40.43 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  31.93 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  36.96 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  32.76 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  35.59 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  31.93 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  36.5 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  31.67 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  32.31 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  36.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  31.11 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  34.52 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  33.88 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  33.88 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  30.34 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  31.36 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  36.81 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  30.51 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  32.56 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  28.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  31.4 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  32.28 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  35.63 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  31.25 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  32.98 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  32.8 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  33.85 
 
 		 150 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  33.72 
 
 		 174 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  30.28 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  37.84 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  28.57 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  34.48 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  26.49 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  28.47 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  37.33 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  25 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  32.52 
 
 		 172 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  31.86 
 
 		 149 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  29.17 
 
 		 161 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  34.15 
 
 		 147 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  29.17 
 
 		 161 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>