51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2231 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  60.87 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  60 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  57.34 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  62.41 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  49.25 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  40.74 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  38.13 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  46.27 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  40.54 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  41.5 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  32.62 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  38.51 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  30.15 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  36.5 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  37.23 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  37.23 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  37.23 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  32.35 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  32.52 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  30.71 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  28.68 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  30.71 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  29.45 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  33.91 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  31.39 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  33.33 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  32.23 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  32.81 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  30.67 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  31.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  27.61 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  27.61 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  29.71 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  28.69 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  32.48 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  28.38 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  31.65 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  31.65 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  31.65 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  35.37 
 
 		 162 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  32.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  25.19 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  36.14 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  31.29 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  34.12 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  28.24 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  29.73 
 
 		 146 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  33.82 
 
 		 146 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>