44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0554 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 142 aa  286  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  63.38 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  62.41 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  59.86 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  55.32 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  53.33 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  47.41 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  36.11 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  36.96 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  33.1 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  41.22 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  35.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  41.43 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  43.92 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  34.51 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  42.18 
 
 		 171 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  39.73 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  31.69 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  31.65 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  29.41 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  30.77 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  34.85 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  28.95 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  37.32 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  36.99 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  31.51 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  39.39 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  35.2 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  35.34 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  29.45 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  25 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  27.39 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  32.29 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  31.11 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  30.85 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  29.58 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  29.85 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  36.71 
 
 		 146 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>