135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0232 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  100 
 
 
171 aa  335  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  89.19 
 
 
166 aa  233  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  70.59 
 
 
164 aa  179  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  65.77 
 
 
161 aa  176  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  69.46 
 
 
165 aa  169  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  47.92 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  39.73 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  35.71 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  41.1 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  41.1 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  39.73 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  42.57 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  43.71 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  42.86 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  41.89 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  31.36 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  32.88 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  41.78 
 
 
141 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  30.43 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  34.93 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  41.89 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  34.93 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  39.62 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  27.71 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  29.59 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  34.17 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  30.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  28.4 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  32.16 
 
 
184 aa  52  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  41.18 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  33.64 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  33.61 
 
 
148 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  33.11 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  37.5 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  34.72 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  40.85 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  28 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  35.29 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  29.22 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  28.57 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  30.82 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  48.33 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  33.09 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  29.37 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  32.35 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  38.1 
 
 
174 aa  47.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  29.61 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  32.08 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  33.54 
 
 
176 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  62.16 
 
 
146 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  32 
 
 
149 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  32.41 
 
 
149 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  32.08 
 
 
159 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  27.56 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  63.89 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  63.89 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  63.89 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  31.94 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  29.45 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  57.89 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  56 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  53.85 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  32.08 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  33.1 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  31.91 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  36.36 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  40.62 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  36.76 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  28.68 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  30.77 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  33.79 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  30.5 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  29.53 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  30.5 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  31.72 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  42.18 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  42.62 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  57.14 
 
 
154 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  43.75 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  33.11 
 
 
147 aa  44.3  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  32.12 
 
 
164 aa  44.3  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  36.67 
 
 
150 aa  44.3  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  35.06 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  36.71 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  61.11 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  28.75 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  31.58 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  33.33 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  33.02 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  45.1 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  42.62 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  29.49 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  39.66 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  31.08 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  29.01 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  32.43 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  31.33 
 
 
147 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>