40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1303 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 
156 aa  309  1e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  80.13 
 
 
156 aa  270  7e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  83.97 
 
 
155 aa  254  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  81.41 
 
 
156 aa  225  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  51.33 
 
 
151 aa  144  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  41.67 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  42.76 
 
 
144 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  38.51 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  41.5 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  48.34 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  39.46 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  38.78 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  38.1 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0436  hypothetical protein  87.76 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  38.52 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  39.74 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  41.91 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  33.97 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  35.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  31.11 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  34.97 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  30.99 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.43 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.43 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  36.3 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  33.78 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  34.75 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  34.69 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  32.43 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  31.41 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  34.48 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  34.72 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  31.65 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  30.68 
 
 
141 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  32.29 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  33.68 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  28.1 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  39.82 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  28.68 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  48.72 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>