86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0723 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  60.18 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  61.06 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  58.77 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  57.52 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  47.41 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  46.09 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  49.48 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  43.86 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  44.74 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  44.74 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  44.74 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  45.3 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  40.87 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  38.94 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  37.93 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  40.71 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  50 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  40 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  42.11 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  41.59 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  41.38 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  43.1 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  39.82 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  37.93 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  35.45 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  36 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  34.57 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  44.78 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  42.65 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  46.27 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  26.96 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  43.48 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  42.47 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  45.71 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  43.48 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  33.71 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  56.41 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  64.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  44.62 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  52.5 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  61.76 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  44.62 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  44.62 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  39.47 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  56.82 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  54 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  42.31 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  37.84 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  62.5 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  61.76 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  58.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  42.37 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  36.36 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  61.76 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  59.38 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  43.08 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  38.67 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  31.25 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 185 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  41.43 
 
 		 149 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 164 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  35.9 
 
 		 184 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  36.84 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  62.5 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  43.21 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  31.97 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  41.54 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  61.76 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  44.62 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  39.47 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  35.37 
 
 		 184 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>