84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1474 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  100 
 
 
117 aa  231  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  52.63 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  55.26 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  55.26 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  55.26 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  51.75 
 
 
139 aa  127  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  52.63 
 
 
120 aa  127  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  56.14 
 
 
121 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  50 
 
 
116 aa  122  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  53.51 
 
 
121 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  50.43 
 
 
117 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  48.25 
 
 
120 aa  121  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  49.57 
 
 
117 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  52.63 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  50.86 
 
 
115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  48.7 
 
 
117 aa  118  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  49.12 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  51.72 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  50 
 
 
120 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  48.21 
 
 
122 aa  101  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 
122 aa  100  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  49.48 
 
 
119 aa  100  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  47.79 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  48.18 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  34.51 
 
 
115 aa  84  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  43.88 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  40.62 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  35 
 
 
184 aa  50.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  33.88 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  35.11 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  35.85 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  42.11 
 
 
243 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  44.59 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  62.16 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  32.67 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  32.67 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  41.43 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  35.87 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  41.18 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  34.41 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  32.67 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  35.63 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  35.63 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  38.57 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  58.33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  25.86 
 
 
192 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
146 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  36.36 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  26.89 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  35.23 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  44.93 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  38.75 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
184 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  35.8 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  53.85 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  38.24 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  35.8 
 
 
146 aa  40.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  33.7 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  30.43 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  51.11 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  46.55 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  62.86 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  35.23 
 
 
150 aa  40.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  47.5 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  32.18 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  56.76 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  39.71 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  39.71 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  39.71 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  34.09 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>