164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0214 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0214  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  100 
 
 		 331 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  30.22 
 
 		 1052 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.93 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  29.87 
 
 		 1005 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  28.12 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 434 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.35 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  27.61 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  29.63 
 
 		 615 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 		 708 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.47 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.94 
 
 		 677 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.84 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.41 
 
 		 432 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.53 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  29.27 
 
 		 1062 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.5 
 
 		 445 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.64 
 
 		 1062 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.5 
 
 		 1062 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 450 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  29.31 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.5 
 
 		 1062 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.41 
 
 		 446 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.66 
 
 		 1062 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  33.96 
 
 		 463 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.71 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.38 
 
 		 1066 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.07 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  30.23 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  30.23 
 
 		 1060 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 969 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.33 
 
 		 590 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.17 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.83 
 
 		 572 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.26 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.33 
 
 		 438 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  28 
 
 		 685 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  29.91 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  23.15 
 
 		 509 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  28.35 
 
 		 445 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  31.78 
 
 		 518 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  28.47 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 		 697 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.82 
 
 		 432 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  28.91 
 
 		 439 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.73 
 
 		 567 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24.47 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 433 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.19 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  24.62 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 433 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 646 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.48 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  28.33 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.62 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  31.43 
 
 		 1042 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.24 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  26.7 
 
 		 1138 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.1 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27 
 
 		 661 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.1 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  32.48 
 
 		 656 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.15 
 
 		 1069 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.44 
 
 		 427 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.82 
 
 		 667 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.82 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.48 
 
 		 430 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.15 
 
 		 664 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.48 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  27.54 
 
 		 457 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  31.13 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.81 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 642 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  32.48 
 
 		 656 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.07 
 
 		 443 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  25.55 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.15 
 
 		 1067 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.73 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.91 
 
 		 692 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  22.65 
 
 		 1082 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  27.68 
 
 		 982 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  30.48 
 
 		 1040 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  27.48 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  29.13 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.23 
 
 		 1028 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>